La Comisión actúa según el plan aprobado, modificado y complementado por el Consejo de Comisarios del Pueblo. En dicho plan se determina el destino de los principales grupos de cargas y la urgencia comparativa de la evacuación de unos u otros grupos.

Al frente de la Comisión se nombra a un plenipotenciario extraordinario, dotado de poderes dictatoriales. Los miembros de la Comisión tienen voto consultivo y el derecho de presentar cuestiones (en caso de que vote a favor de ello no menos de 1/3 del total de miembros) al Consejo de Comisarios del Pueblo.